Sin embargo, la PCR genera controversia en el análisis de alérgenos. El principal punto de crítica es el hecho de que la PCR es solo un indicador directo del potencial alergénico de un producto alimenticio: Se puede concebir que un producto alimenticio (procesado) contenga poco o nada de ADN, y aún así contenga una gran cantidad de proteína alergénica.
Ventajas de la PCR
A pesar de esta objeción, la PCR es adecuada para el análisis de alérgenos y, en algunos casos, es incluso superior al método de ELISA establecido, en particular con respecto a la especificidad y la capacidad de detección simultánea de múltiples dianas (multiplex).
| PCR | ELISA | |
|---|---|---|
| Detección de | ADN | Proteína |
| Sensibilidad | Alta a muy alta; puede haber efectos de la matriz | Alta a muy alta; puede haber efectos de la matriz |
| Especificidad | Muy alta | Media; puede haber reacciones cruzadas |
| Preparación de muestras | Estandarizada | No estandarizada |
| Ejecución de la prueba | Muy eficiente cuando se realizan varios ensayos; bastante compleja y cara para un solo ensayo | Simple y económica |
| Resultados del ensayo | Cualitativos; puede hacerse una evaluación cuantitativa mediante un factor de conversión adicional | Cuantitativos |
| Automatización | Se puede automatizar totalmente | Se puede automatizar parcialmente |
| Análisis multiplex | Posible (3 parámetros simultáneos) | No es posible |
| Análisis de muestras procesadas | Posible, siempre que el ADN permanezca intacto | Posible, siempre que la proteína diana permanezca intacta |
| Tiempo requerido | De 2 a 3 horas | De 0,5 a 2 horas |
Limitaciones de la PCR en el análisis de alérgenos
La PCR es, por lo tanto, un complemento excelente para los ensayos de ELISA, en particular para las pruebas confirmatorias o para la detección de parámetros tales como apio o pescado, en donde los ensayos de ELISA tienen dificultades con la reactividad cruzada. Pese a ello, la PCR tiene sus límites: No se puede detectar leche y huevo con PCR, puesto que el análisis detectaría solo ADN de vaca o pollo. Y aún cuando el ADN es una molécula altamente estable, no sobrevive a todos los procesos: Los alimentos muy procesados, tales como aceites vegetales, gelatina, lecitina o almidón, contienen poco o nada de ADN y son un reto para los ensayos de PCR. En general, todos los métodos disponibles tienen sus ventajas y desventajas y la decisión dependerá siempre de la aplicación específica.
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